疾病的分類是為了正確的診斷，正確的診斷是為了指導治療。

    我國將肛瘺分為單純性和復雜性兩大類，再進一步分為低位和高位，這種分類適合于初學者，入門容易。其最大的不足之處是分類粗糙，體現不出肛瘺的具體解剖位置，對手術指導意義不大。

    Parks的4類分法簡單明了，易學易記，如果對盆底解剖了解的不是很好，初學者對瘺和肌性復合體的關系不好把握。

    Eisenhammer的3類5型分類法是建立在他的“肌間瘺性膿腫”新理論和解剖基礎之上的，對手術治療的指導性很強，具有較強的實用性。不過，他認為外群的坐骨直腸窩瘺和皮下瘺是非肛隱窩性膿腫和臨床所見并不完全一致。

    隅越幸男的4類10型分類法是Eisenhammer3類5型分類法的進一步擴展，更注重了瘺的解剖位置的界定，尤其對復雜性肛瘺的手術指導意義重大。這種分類法應該是目前最好的分類方法。其缺點是分類繁瑣，初學者不宜掌握，尤其在沒有感性認識的情況下，看著這么多的分型有一頭霧水的感覺。

    對于隅越幸男的4類10型分類法，首先對第IV型的肛提肌上瘺只做了解即可，也許你10年20年會遇到1例，也許你一輩子都遇不到1例。第I型的皮下瘺和黏膜下瘺較常見也好理解。第III型的肛提肌下瘺，主要指坐骨直腸窩瘺，有單側和雙側之分，也較常見，至于其它更細致的分型就先不要理會它。最主要而又難辦的是第 II型內外括約肌瘺，解剖涉及內外括約肌和恥骨直腸肌，尤其高位內外括約肌間瘺難以辨認和處理，這需要十分熟悉盆底的解剖關系。

    絕大部分的肛瘺是需要手術治療的，是手術就要清楚解剖結構，所以，肛瘺的分類應該著重解剖分類。我國的肛瘺分類更像是一種經驗分類，國外的肛瘺分類是解剖分類。為了提高肛瘺（尤其是復雜肛瘺）的治愈率，肛瘺的分類應該由經驗型分類向解剖型分類過渡。