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科學(xué)家發(fā)現(xiàn)漢族人發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)新的宮頸癌易感位點(diǎn)

2013-10-23 22:08 閱讀:1845 來源:生物通 作者:網(wǎng)* 責(zé)任編輯:網(wǎng)絡(luò)
[導(dǎo)讀] 為了鑒定宮頸癌的遺傳風(fēng)險(xiǎn)因素,華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院等多家機(jī)構(gòu)的研究人員在漢族人群中開展了全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS),發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)新的宮頸癌易感位點(diǎn).這項(xiàng)研究成果于8月發(fā)表在《Nature Genetics》雜志上.領(lǐng)導(dǎo)這一項(xiàng)研究的是華中科技大學(xué)的馬丁教授.

    一提起宮頸癌,大家首先想到的罪魁禍?zhǔn)卓隙ㄊ侨巳轭^瘤病毒(HPV).這是一種常見的病毒,通過性接觸傳播.然而,大部分HPV感染可自行消退,只有不到4%的個(gè)體會(huì)發(fā)展成持續(xù)感染,進(jìn)而有可能發(fā)展成癌前病變或癌癥.這表明,宿主遺傳特征和病毒之間也存在著復(fù)雜的關(guān)系.

    為了鑒定宮頸癌的遺傳風(fēng)險(xiǎn)因素,華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院等多家機(jī)構(gòu)的研究人員在漢族人群中開展了全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS),發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)新的宮頸癌易感位點(diǎn).這項(xiàng)研究成果于8月發(fā)表在《Nature Genetics》雜志上.領(lǐng)導(dǎo)這一項(xiàng)研究的是華中科技大學(xué)的馬丁教授.

    在發(fā)展中國(guó)家,宮頸癌是導(dǎo)致婦女死亡的最主要的惡性腫瘤之一.大量的流行病學(xué)和臨床證據(jù)表明,高危型HPV的持續(xù)感染是主要的風(fēng)險(xiǎn)因素,也是發(fā)展成宮頸癌所必需的;在99.7%的宮頸癌病例中檢測(cè)到HPV感染.然而,單純的HPV感染卻不足以引起腫瘤發(fā)展,大部分感染可自行消退.種種跡象表明,宮頸癌也與遺傳因素和外部環(huán)境因素相關(guān).

    于是,研究人員在漢族人群中開展了大規(guī)模的GWAS研究.首先在發(fā)現(xiàn)階段,他們利用Affymetrix的Axiom Genome-Wide CHB1芯片對(duì)1,364個(gè)病例和3,028個(gè)女性對(duì)照進(jìn)行了基因分型.Axiom Genome-Wide CHB1是一款專為漢族人群而設(shè)計(jì)的芯片,其內(nèi)容精選自Axiom基因組數(shù)據(jù)庫,最大限度地覆蓋了常見的等位基因(MAF >5%).在這一階段,研究人員總共發(fā)現(xiàn)了41個(gè)明顯關(guān)聯(lián)的SNP.

    之后,他們對(duì)這41個(gè)SNP位點(diǎn)中的22個(gè)(其中忽略的19個(gè)處于連鎖不平衡狀態(tài))進(jìn)行了第二階段的跟進(jìn)研究.這一階段包括兩個(gè)獨(dú)立的樣本組:第一組包括1,824個(gè)病例和3,808個(gè)對(duì)照;第二組包括2,343個(gè)病例和3,388個(gè)對(duì)照.對(duì)于第一組,22個(gè)SNP中的13個(gè)是統(tǒng)計(jì)學(xué)上顯著的.隨后,他們又對(duì)第二組開展了這13個(gè)SNP的基因分型.

    綜合這三個(gè)階段的結(jié)果,研究人員發(fā)現(xiàn)了2個(gè)新的SNP位點(diǎn)(rs1311117307和rs8067378),它們所在或鄰近的染色體區(qū)域(EXOC1[4q12]和GSDMB[17q12])是宮頸癌的易感區(qū)域.同時(shí),研究人員也確認(rèn)了之前鑒定出的一個(gè)位點(diǎn)(rs4282438),它定位在6p21.32上的HLA-DPB1和HLA-DPB2之間(HLA-DPB1/2).

    研究人員認(rèn)為,EXOC和GSDMB區(qū)域,以及HLA-DP等位基因中易感位點(diǎn)的確定,表明T細(xì)胞介導(dǎo)的免疫反應(yīng)或腫瘤細(xì)胞增殖可能發(fā)揮了重要的作用.這些遺傳因素可能影響HPV持續(xù)感染和整合的機(jī)制,從而與宮頸癌風(fēng)險(xiǎn)相關(guān).這一發(fā)現(xiàn)為宮頸癌的遺傳病因提供了新的見解,對(duì)癌癥的預(yù)防和治療具有重要意義.


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