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超越基因測序,揭示“癌中之王”致病基因

2014-12-18 16:20 閱讀:1280 來源:生物360 責(zé)任編輯:李思杰
[導(dǎo)讀] 德國慕尼黑工業(yè)的研究人員利用一項新技術(shù)鑒別出了基因測序難以辨認(rèn)的癌癥病因,揭示出了大量從前未知的胰腺癌基因。其有望推動對于這一目前仍知之甚少的疾病的研究。相關(guān)論文發(fā)表在12月8日的《自然-遺傳學(xué)》(Nature Genetics)雜志上。 胰腺癌是惡性度高、

    德國慕尼黑工業(yè)的研究人員利用一項新技術(shù)鑒別出了基因測序難以辨認(rèn)的癌癥病因,揭示出了大量從前未知的胰腺癌基因。其有望推動對于這一目前仍知之甚少的疾病的研究。相關(guān)論文發(fā)表在12月8日的《自然-遺傳學(xué)》(Nature Genetics)雜志上。
 


    胰腺癌是惡性度高、預(yù)后差的一種腫瘤,在過去的40年里患者的5年生存率一直在5%左右。由于胰腺的位置隱蔽,早期胰腺癌很難被發(fā)現(xiàn),多數(shù)患者確診時已是晚期,加之病死率極高,因此被稱為“癌中之王”.

    這一技術(shù)是通過將稱作為piggyBac轉(zhuǎn)座子的DNA片段導(dǎo)入到小鼠基因組中來起作用的。轉(zhuǎn)座子能夠在基因組中四處跳躍,將自身重新插入隨機位點,在每個小鼠細(xì)胞中生成不同的突變,這觸發(fā)了癌癥形成。通過在腫瘤中追蹤這一轉(zhuǎn)座子的指紋,研究人員發(fā)現(xiàn)了受累的致癌基因。這是研究人員首次操控PiggyBac工具在小鼠的個別組織中誘導(dǎo)癌癥,現(xiàn)在這一方法可用于研究所有的癌癥類型。

    盡管基因組測序可以高精確度鑒別所有類別的遺傳變異,卻難以解讀其中的一些改變。例如,在癌癥中有數(shù)百或數(shù)千個基因被發(fā)現(xiàn)在轉(zhuǎn)錄或表觀遺傳水平上出現(xiàn)了異常調(diào)控,這意味著它們并沒有發(fā)生突變而是被開啟或關(guān)閉。在這樣大量的基因中精確找到少數(shù)的致癌事件非常的困難。由于轉(zhuǎn)座子可以直接跳躍到相關(guān)基因中,PiggyBac篩查可以讓這種大海撈針的搜索變得更容易。并且,這一工具還可監(jiān)測小鼠體內(nèi)的腫瘤形成,因此研究人員還能夠看到癌性突變的影響,以及它們推動疾病進展的機制。

    慕尼黑工業(yè)大學(xué)和德國癌癥研究中心的Roland Rad教授說:“近期在癌癥基因組測序中取得的一些進展提供了有關(guān)癌癥潛在遺傳事件的一些非凡見解。盡管如此,我們?nèi)赃h未充分認(rèn)識驅(qū)動癌癥形成的分子過程的復(fù)雜性。在小鼠中進行無偏倚的全基因組篩查使得我們能夠從不同的角度來查看癌癥,解答采用其他方法無法解決的一些生物學(xué)問題。”

    這項研究鑒別出了許多從前未知的、與胰腺癌相關(guān)的基因,包括Foxp1,在所研究的49個小鼠腫瘤中轉(zhuǎn)座子以非常高的頻率擊中了它。在誘導(dǎo)Foxp1的地方,腫瘤從胰腺擴散到了其他的器官,表明這一基因驅(qū)動了癌癥進展。當(dāng)研究人員檢測人類樣本時這一研究發(fā)現(xiàn)得到了證實,他們發(fā)現(xiàn)在已發(fā)生轉(zhuǎn)移的癌癥中有高水平的**P1基因產(chǎn)物。

    在許多小鼠中,轉(zhuǎn)座子插入到了基因組的非編碼區(qū)域。這些插入準(zhǔn)確地定位了與一些致癌基因調(diào)控相關(guān)的增強子區(qū)域。此外,與人類相似,小鼠形成了各種亞型的胰腺癌,它們不僅顯示差異性的鏡下特點,也表現(xiàn)不同的臨床行為。這項研究發(fā)現(xiàn)了負(fù)責(zé)觸動這些癌癥亞型形成的一些分子過程。

    研究人員現(xiàn)正更密切地檢測這項研究發(fā)現(xiàn)的一些胰腺癌基因,希望能夠找到針對這一疾病的有效藥物。到2030年胰腺癌將成為第二位的癌癥死亡原因。一些實驗室也已開始利用這一技術(shù)調(diào)查其他組織的癌癥。


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