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高通量基因產(chǎn)前篩查與診斷技術(shù)規(guī)范解讀

2015-03-04 19:45 閱讀:2776 來源:中國婦產(chǎn)科網(wǎng) 作者:學**涯 責任編輯:學海無涯
[導讀] 近日,國家衛(wèi)生計生委婦幼司委托中華醫(yī)學會、國家衛(wèi)生計生委臨床檢驗中心和產(chǎn)前診斷技術(shù)專家組評估確定的第一批高通量測序技術(shù)臨床應(yīng)用試點單位名單公布,獲得開展遺傳病診斷、產(chǎn)前篩查與診斷、植入前胚胎遺傳學診斷3個專業(yè)的試點工作。

    近日,國家衛(wèi)生計生委婦幼司委托中華醫(yī)學會、國家衛(wèi)生計生委臨床檢驗中心和產(chǎn)前診斷技術(shù)專家組評估確定的第一批高通量測序技術(shù)臨床應(yīng)用試點單位名單公布,獲得開展遺傳病診斷、產(chǎn)前篩查與診斷、植入前胚胎遺傳學診斷3個專業(yè)的試點工作。

    研究制定了《高通量基因測序產(chǎn)前篩查與診斷技術(shù)規(guī)范(試行)》。全國109家醫(yī)療機構(gòu)獲批開展了基于第二代測序技術(shù)的無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(noninvasive prenatal testing,NIPT)高通量測序試點工作。國家衛(wèi)生計生委婦幼司發(fā)布的《關(guān)于加強臨床使用基因檢測相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)管理的通知》(食藥監(jiān)辦械管[2014]25號)中,明確描述了試點單位的工作內(nèi)容,具體包括:產(chǎn)前篩查與診斷前咨詢、適用范圍、知情同意書簽署、臨床資料收集和標本采集要求、檢測報告審核使用、檢測后臨床咨詢、高風險孕婦的后續(xù)臨床服務(wù)、追蹤隨訪、信息統(tǒng)計上報以及為規(guī)范開展高通量基因測序產(chǎn)前篩查與診斷臨床服務(wù)工作需要試點的其他相關(guān)內(nèi)容。

    南方醫(yī)科大學南方醫(yī)院被選為首家獲得試點工作單位之一,該院產(chǎn)科鐘梅主任應(yīng)邀接受本網(wǎng)站的采訪,就《高通量基因測序產(chǎn)前篩查與診斷技術(shù)規(guī)范(試行)》做出了專業(yè)解讀。

    1、無創(chuàng)產(chǎn)前檢查的定義

    根據(jù)獲取胎兒標本的不同方法來分類,產(chǎn)前檢查分為有創(chuàng)傷性和無創(chuàng)傷性兩種。目前,有創(chuàng)性產(chǎn)前診斷是診斷胎兒染色體疾病的金標準,主要是指通過絨毛活檢術(shù)、羊水穿刺術(shù)和臍靜脈穿刺術(shù)采集胎兒細胞或組織,來獲取胎兒染色體信息。有創(chuàng)檢測的準確率為98%-99%,但伴有0.5%-1%的流產(chǎn)風險,同時也會伴有羊水滲漏、宮內(nèi)感染等風險,因此有創(chuàng)產(chǎn)前診斷目前僅應(yīng)用于篩查高風險、高齡妊娠或家庭中生育過遺傳病患兒等情況。

    傳統(tǒng)的無創(chuàng)性產(chǎn)前檢查主要有超聲檢查和孕婦血清學檢測等方法,使用這些方法進行檢測可避免對胎兒和孕婦造成的危害,但是其靈敏度及特異性有限。近二十年來,基于超聲檢查和孕婦各種蛋白或激素的血清篩查相結(jié)合的產(chǎn)前篩查發(fā)展迅速。產(chǎn)前血清學篩查的目標疾病是21、18-三體綜合征和神經(jīng)管缺陷,其在早孕期、中孕期、早結(jié)合中孕期的檢出率分別為83%、81%、94%-96%,假陽性率為5%左右,這些方法的假陽性率較高,為后續(xù)有創(chuàng)性產(chǎn)前診斷帶來較大的臨床壓力與實驗室壓力,帶來了一些不必要的穿刺。

    近年來,隨著新一代高通量測序技術(shù)的發(fā)展,出現(xiàn)了基于第二代測序技術(shù)的無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(noninvasive prenatal testing,NIPT)技術(shù),簡稱無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測。

    2、無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測如何定義?

    研究表明,整個孕期在孕婦的外周血中長期穩(wěn)定地存在著大量來自胎兒的游離DNA片段,大約孕7周后游離胎兒DNA以一定的比例穩(wěn)定存在于孕婦外周血中,并且隨著孕周的增大比例也而緩慢上升。

    只抽取孕婦的外周血,提取其中的游離胎兒DNA,采用新一代高通量測序技術(shù),結(jié)合生物信息分析來檢測胎兒基因的技術(shù),就是無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測技術(shù)。這樣有效避免了像絨毛活檢術(shù)、羊水穿刺術(shù)和臍靜脈穿刺術(shù)等有創(chuàng)檢查對胎兒和孕婦造成的危害。

    3、無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測能查什么疾???

    目前在臨床上應(yīng)用的,是針對染色體非整倍性疾病,主要是21-三體又稱唐氏綜合征,18-三體,13-三體3種疾病的產(chǎn)前檢測。

    處于研究階段的疾病有多種,像地中海貧血、假肥大性肌營養(yǎng)不良(DMD),血友病等。隨著測序深度的增加和生物信息學的發(fā)展,能夠應(yīng)用于臨床檢測的疾病將會越來越多。

    4、NIPT 技術(shù)應(yīng)用的目標疾病及技術(shù)定位有哪些?

    專家共識指出該技術(shù)在目前發(fā)展階段的目標疾病應(yīng)該明確在胎兒21-三體、18-三體和13-三體綜合征,臨床應(yīng)用宜定位于“近似于產(chǎn)前診斷水平的”、“目標疾病指向精確的”產(chǎn)前篩查技術(shù)。

    主要的理由有以下幾點:

    (1)。多個臨床研究結(jié)果已經(jīng)充分證實了該技術(shù)用于21-三體、18-三體、13-三體產(chǎn)前篩查有良好的臨床有效性;(2)。這些研究中都存在21 -三體、18-三體、13- 三體和性染色體異常檢測的假陰性病例和檢測失敗的病例(2%-5%);(3)。這些研究提示,性染色體異常無創(chuàng)性診斷的符合率較低(約25%);(4)。從技術(shù)角度分析,雙胎或多胎、嵌合體及父母中存在染色體異常的病例均不適于進行NIPT分析,該部分病例約占所有病例的5%;(5)。該技術(shù)由于發(fā)展過程的局限性,現(xiàn)階段對于其他染色體三體異常、結(jié)構(gòu)異常及微缺失綜合征尚缺乏有效的篩查指示作用。

    5、無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測優(yōu)勢有哪些?

    (1)。 傳統(tǒng)血清學篩查方法假陽性和漏檢風險均較高;新技術(shù)對于目標疾病存在高檢出率和低假陽性率。篩查孕周范圍大,可以應(yīng)用于早孕期和中孕期,甚至孕23周以后。

    (2)。 無創(chuàng)產(chǎn)前基因診斷僅采集少量母血,提取其中的游離胎兒DNA進行檢測。所需信息少,取材便捷,流程較簡單,質(zhì)量控制相對容易。技術(shù)有后續(xù)進一步發(fā)展的空間。

    (3)。 傳統(tǒng)產(chǎn)前診斷采用侵入性取樣方法,有感染、流產(chǎn)等風險;可以有效地降低后續(xù)侵入性產(chǎn)前診斷的數(shù)量,解決產(chǎn)前診斷技術(shù)力量不足的問題。

    6、無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測存在哪些局限?

    (1)。 篩查的目標疾病尚偏少,縮小了后續(xù)產(chǎn)前診斷的疾病范圍。

    (2)。 雙/多胎、嵌合體以及父母中存在染色體異常的病例均不適于進行該技術(shù)的篩查。

    (3)。 無創(chuàng)產(chǎn)前基因篩查仍無法取代有創(chuàng)的產(chǎn)前診斷檢查(假如無創(chuàng)檢測結(jié)果為陽性,仍需做羊水或臍血穿刺明確診斷)。

    7、無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測的準確性如何?

    該技術(shù)對目標疾病有高檢出率和低假陽性率。該技術(shù)對于21-三體等常見染色體非整倍體異常總體檢出率在99%以上,假陽性率在0.1%左右,大大優(yōu)于目前產(chǎn)前血清學篩查的效率。

    但是現(xiàn)在篩查的目標疾病僅為21-三體、18-三體、13-三體,而人有23對染色體,所以無法知道其他染色體的情況。有創(chuàng)性產(chǎn)前診斷仍然是診斷胎兒染色體疾病的金標準。

    8 、無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測適應(yīng)人群?

    (1)。不能做有創(chuàng)產(chǎn)前診斷的孕婦,像有先兆流產(chǎn)、發(fā)熱、出血傾向、感染未愈等情況的孕婦;(2)。 產(chǎn)前篩查臨界高風險孕婦(如風險率在1/270-1/1000);(3)。高齡孕婦(年齡大于35歲)不合并其他染色體病高危因素時;(4)。珍貴兒妊娠,知情后拒絕介入性產(chǎn)前診斷的孕婦;(5)。對介入性產(chǎn)前診斷極度焦慮的孕婦;

    (6)。無法預約到產(chǎn)前診斷的孕婦。

    9 、哪些情況下不適合做無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測?

    (1)。產(chǎn)前B超檢查異常的孕婦;

    (2)。雙胎或多胎孕婦;

    (3)。夫婦之中任何一方有明確染色體結(jié)構(gòu)或數(shù)目異常時;(4)。胎兒疑有微缺失綜合征、有其他染色體異?;蚧虿〉脑袐D;(5)。接受過異體輸血、移植手術(shù)、干細胞治療、免疫治療的孕婦。

    10、什么時候可以做無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測?

    在南方醫(yī)科大學南方醫(yī)院婦產(chǎn)科,懷孕9周-26周的孕婦均可抽血做無創(chuàng)產(chǎn)前基因篩查。

    11、做無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測前需要做哪些準備?

    帶齊化驗資料到醫(yī)院就診即可,本檢查不需要空腹,所以孕婦可以在飯后檢查。

    下面是南方醫(yī)院的基于第二代測序技術(shù)的無創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(noninvasive prenatal testing,NIPT)的數(shù)據(jù): 2010-2014,5年共做1080例,共發(fā)現(xiàn)10例異常,21-三體8例,性染色體異常2例。最終通過羊水穿刺確診:21-三體8例,性染色體異常1例。有1例性染色體異常的為假陽性。無漏診情況。

    12 、高通量測序技術(shù)能夠應(yīng)用于遺傳病的基因診斷嗎?

    目前的研究表明,應(yīng)用高通量測序技術(shù)對單基因遺傳病家系的全基因組測序可以鑒定出致病突變。這樣對有眾多致病基因、遺傳異質(zhì)性強的遺傳病也有可能做出高速及確切地基因診斷。另外,隨著測序費用的不斷下降及時間縮短,個人基因組測序可能會成為個性化醫(yī)療保健的基礎(chǔ)。

    13 、高通量測序技術(shù)能夠取代基因芯片嗎?

    高通量測序技術(shù)一次可獲得上百萬條、甚至幾百萬條序列信息,因此具有取代“基因芯片”技術(shù)的態(tài)勢。

    由于基因芯片的檢測范圍取決于芯片上探針的信息,因此只能檢測人們已知序列的特征,缺乏發(fā)現(xiàn)尋找新基因的能力,而高通量測序則能夠很好地彌補基因芯片這方面的不足。

    但就目前而言,高通量測序技術(shù)建立的時間還很短,技術(shù)不是很成熟,其信息儲備量也很有限;而基因芯片技術(shù)已經(jīng)發(fā)展了20余年,其實驗技術(shù)及后期數(shù)據(jù)分析理論已經(jīng)很成熟很完備,也積累了龐大的公共數(shù)據(jù)庫,因此短時間內(nèi)基因芯片技術(shù)還會占據(jù)主導優(yōu)勢。但相信在不久的將來,高通量測序技術(shù)將會越來越成熟并得到更加廣泛的應(yīng)用。

    高通量試點單位名單的公布為整個行業(yè)帶來了信心,意味著基因檢測產(chǎn)業(yè)將“有法可依”,整個行業(yè)秩序回歸理性與正常。對于罕見病家庭及有基因檢測需求的孕婦來說,從此有了檢測基因的正規(guī)渠道,可以幫助這類家庭規(guī)避遺傳風險,生育健康的下一代,這是一件利國利民的好事!


作者:李慧玲

    專家簡介:

    鐘梅教授,主任醫(yī)師,博士生導師,南方醫(yī)科大學南方醫(yī)院婦產(chǎn)科主任,全國婦產(chǎn)科醫(yī)師協(xié)會委員,廣東省圍產(chǎn)醫(yī)學分會副主委。從事婦產(chǎn)科臨床、科研及教學工作35年,有豐富的臨床經(jīng)驗,擅長于高危妊娠的診治、孕產(chǎn)婦危急重癥搶救和產(chǎn)前診斷、遺傳咨詢等方面,尤其對地中海貧血、其他遺傳性疾病的產(chǎn)前早期診斷及防止有較深入的研究。
 


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